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olga:olgaplasmidminipraep [2020-04-10 04:17]
danield
olga:olgaplasmidminipraep [2020-06-25 20:07] (current)
danield
Line 1: Line 1:
-** Baustelle ** 
  
 +==== DNA Plasmidpräparation (Minipräp) ====
  
-**Lösungen für die Minilysatpräparation von Plasmid DNA**__Underlined Text__+Die Plasmidpräparation (auch Plasmidisolierung) ist eine molekularbiologische Methode zur Isolierung von Plasmid-DNA. Die Bezeichnung "​Mini-"​ stammt von der minimalen Menge mit denen gearbeitet wird. Es gibt nämlich auch die Midi- oder Maxipräp mit größeren Volumina. 
 + 
 + 
 +Im OLGA gibt es einfertiges DIY-Minipräp-Kit mit den Lösungen und der Anleitung. Dieses kann/​darf/​soll ein jeder benutzen. 
 + 
 +[[https://​galley.realraum.at/​_data/​i/​upload/​2018/​12/​01/​20181201172452-90210fd6-me.jpg|{{https://​galley.realraum.at/​_data/​i/​upload/​2018/​12/​01/​20181201172452-90210fd6-me.jpg?​300x500}}]] 
 + 
 +==== Lösungen für die Minilysatpräparation von Plasmid-DNA ====
  
 **Lösung I:** (400 µL) **Lösung I:** (400 µL)
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 **Ethanol: 70%** (800 µL) **Ethanol: 70%** (800 µL)
  
 +**ddH20 (Fresenius Wasser, DNase-freies Wasser)** (20-50 µL]
 +
 +--------------------
 +==== Rätsel ====
 +
 +3 Tubes mit den Lösungen I, II & III liegen vor einem. Die Beschriftung ist nicht mehr erkennbar. Wie kann man trotzdem feststellen,​ um welche Lösungen es sich handelt OHNE die Lösungen zu entnehmen?
 +
 +1) Riechen: Lösung III riecht nach Essig wegen KAc.
 +
 +2) Schütteln: Lösung II bildet Schaum wegen SDS.
 +
 +3) Lösung 1 bleibt nach Ausschlussverfahren übrig.
 +
 +
 +---------------------------
 +
 +==== Durchführung:​ ====
 +
 +1. Bakterien werden aus 3 ml ONC geerntet. Dazu 1,5 ml ONC in ein Mikroreaktionsgefäß
 +(Eppi) füllen und 1 min x 10,000 rpm in der Tischzentrifuge zentrifugieren. Entfernen
 +des Überstands. Erneut 1,5 ml ONC in Eppi füllen und Zentrifugation wiederholen.
 +Entfernen des Überstands.
 +
 +2. Resuspendieren des Zellpellets in 400 µl Lösung I (4°C). Das Pellet muss vollständig
 +resuspendiert werden.
 +
 +3. Zugabe von 400 µl Lösung II, vorsichtig mischen (kippen) und 5 min bei Raumtemperatur
 +inkubieren. Die Lösung im Eppi wird klar und zäh.
 +
 +4. Zugabe von vorgekühlter (Eis!) 400 µl 2,8M Kaliumacetatlösung,​ pH 5,1 und gut mischen
 +(kippen/​invertieren),​ aber nicht vortexen! Es entsteht ein weißer, flockiger Niederschlag.
 +Das Eppi 15 min auf Eis stellen.
 +
 +5. 10 min bei höchster Umdrehung in der Tischzentrifuge zentrifugieren.
 +
 +6. ca. 800 µl Überstand wird ohne Flocken in ein frisches Eppi überführt,​ mit 600 µl
 +Isopropanol gemischt (kippen/​invertieren),​ aber nicht vortexen!
 +
 +7. Zentrifugation für 15 Minuten bei 4°C und 10.000 rpm (Eppendorf-Zentrifuge),​ um DNA
 +zu pelletieren. Der Überstand wird entfernt und das Pellet mit 800 µl eiskaltem 70%-
 +igen Ethanol gewaschen. Zentrifugation für 15 min siehe oben. Der Überstand wird
 +vollständig entfernt und das Pellet luftgetrocknet (offener Deckel).
 +Optional: Trocknen mit offenem Deckel bei 37°C für 10-15 Minuten.
 +
 +8. Das Pellet in 20 µl H20 lösen.
 +
 +9. 3 µl der gelösten Plasmid DNA werden in ein neues Eppi überführt und für nachfolgende
 +Schnittkontrollen bei -20°C gelagert. Eppi gut beschriften!
 +
 +10. 15µl der restlichen Plasmid-DNA für den Restriktionsansatz verwenden und die
 +verbleibende Plasmid DNA bei -20°C aufbewahren. Eppis gut beschriften!
 +
 +--------------------------------
 +Quellenangabe:​
 +
 +"​Molekularbiologische Übungen 1" Skriptum 2012, Institut für Molekulare Biowissenschaften,​ Karl-Franzens Universität Graz
realraum Graz, Brockmanngasse 15, 8010 Graz, realraum - Verein für Technik in Kultur und Gesellschaft
  • /var/lib/dokuwiki/data/attic/olga/olgaplasmidminipraep.1586485035.txt.gz
  • Last modified: 2020-04-10 04:17
  • by danield